Пилот заводской команды Yamaha Маверик Виньялес на последних секундах финала квалификации Гран При Сан-Марино показал лучшее время и завоевал поул. Он опередил остальных участников на байках Yamaha, которые доминировали на трассе в Мизано.
На протяжении всего финала гонщики на Yamaha поочередно показывали лучшее время. Однако в своей последней попытке Виньялес смог улучшить на всех секторах трассы и опередил ближайшего соперника на 0.312 секунды. Вторым стартует Франко Морбиделли, третье время осталось за Фабио Куартараро.
Валентино Росси, который был быстрейшим в третьей тренировке, стартует четвертым, став самым медленным на Yamaha.
Лучшим из остальных стал Джек Миллер на Ducati. Он проиграл победителю квалификации 0.641 секунды.
В финальную часть квалификации не попал никто из гонщиков на мотоциклах Honda и Aprilia. В десятку по итогам третьей тренировки также не вошли гонщики на KTM, однако Пол Эспаргаро и Мигель Оливейра смогли пробиться в финал по итогам первой части квалификации.
Квалификация запомнилась падением Пола Эспаргаро. Гонщик заводской команды KTM вернулся в боксы, но под конец сессии все же вернулся на трассу и показал 11-е время.
