Итальянский гонщик Франческо Баньяя одержал уверенную победу на Гран При Японии в Мотеги, возглавив гонку от старта до финиша. Его главный соперник Хорхе Мартин совершил впечатляющий прорыв с 11-го места на старте и финишировал вторым, уступив победителю чуть более секунды. Благодаря этому результату, Баньяя сократил отставание от лидирующего в чемпионате Мартина до 10 очков за 4 этапа до конца сезона.
Стартовавший с поул-позиции Педро Акоста из команды Tech3 KTM не смог реализовать свой шанс на подиум, упав уже на третьем круге гонки, когда шёл вторым позади Баньяи. Днём ранее молодой испанец также разбил свой мотоцикл, лидируя в субботнем спринте. Эти ошибки могут дорого стоить Акосте в борьбе за звание лучшего новичка сезона.
Первые круги гонки выдались богатыми на обгоны и борьбу. Прорыв совершили Марк Маркес из Gresini Ducati и Хорхе Мартин, стартовавшие только 9-м и 11-м соответственно. Уже на 4-м круге Мартин вышел на вторую позицию, опередив Брэда Биндера на заводском KTM. Другой гонщик австрийской команды, Джек Миллер, также ярко начал гонку, прорвавшись с 14-го места на 5-е, но затем откатился назад.
В то же время разочаровывающую гонку провели некоторые гонщики, блиставшие в квалификации. Маверик Виньялес на Aprilia после контакта с Маркесом в первом повороте откатился на 9-е место, а затем и вовсе сошёл с дистанции. Гонщики команды VR46 Фабио Ди Джаннантонио и Марко Бедзекки также потеряли много позиций на старте, но затем смогли прорваться на 7-е и 8-е места на финише.
Начиная с 5-го круга гонка приобрела спокойный характер. Баньяя и Мартин оторвались от преследователей, возглавляемых Маркесом, Биндером и Энеа Бастьянини. Последний на 11-м круге опередил Биндера и финишировал четвёртым. Маркес до конца гонки сдерживал натиск Бастьянини и удержал третье место на подиуме.
В концовке гонки Франко Морбиделли из Pramac Ducati опередил Биндера в борьбе за 5-е место. Следом финишную черту пересекли Бедзекки, Ди Джаннантонио, Алеш Эспаргаро на Aprilia, Миллер, Жоан Зарко из LCR Honda, Фабио Куартараро на Yamaha и местный гонщик Такааки Накагами, для которого это был последний домашний Гран-при в карьере.
Очки также заработали Лука Марини из заводской команды Honda и Рауль Фернандес на Aprilia команды Trackhouse. Всего до финиша добрались 15 из 22 стартовавших гонщиков, что говорит о сложных условиях на японской трассе, омрачённых многочисленными авариями по ходу уик-энда.
